ISSR-MARKER SYSTEMS USING IN HORSE -BREEDING
Abstract
By the ISSR-PCR method 7 populations of horses (Arabian breed, the Orlov Trotter, Trakehner, Novoaleksandrovskiy Thoroughbred Horse, Ukrainian horse breed, Przewalski horses) was studied and the most informative ISSR-marker systems was selected. It showed that the number of amplification products and their polymorphism varied considerably depending on the crustal microsatellite motif used as a primer. ISSR-S2 and S10 systems are the most informative for the analysis of DNA polymorphism in horses, on which about 20 amplified genomic loci observed interbreeding and inbreeding differentiation.
About the Authors
U. F. Kurylenko
National University of Life and Environmental Sciences of Ukraine
Russian Federation
Russian Federation
I. A. Suprun
National University of Life and Environmental Sciences of Ukraine
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Highly informative nature of inter simple sequence repeat (ISSR) sequences amplified using triand tetra-nucleotide primers from DNA of cauliflower (Brassica oleracea var. botrytis L.) / B. Bornet [et al.] // Genome. - 2002. - Vol. 45. - P. 890-896.
2. Zietkiewicze, Е. Genome finger-printing by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reactiоn amplification / Е. Zietkiewicze, A. Rafalski, D. Labuda // Genomics. - 1994. - Vol. 20. - P. 176-183.
3. Бардуков, Н. В. Профили ДНК-маркеров (ISSR-PCR) у лошадей рысистых пород / Н. В. Бардуков, Г. К. Коновалова, В. И. Глазко // Известия ТСХА. - 2010. - № 6. - С. 152-157.
4. Метлицька, О. І. Методологія ДНК-паспортизації генофондів сільськогосподарських тварин за гіперваріабельними локусами геному : дис. … д-ра с.-г. наук : 03.00.15 / Метлицька Олена Іванівна. - Полтава, 2012. - 382 с.
5. Применение межмикросателлитного анализа ДНК для оценки популяционной структуры, идентификации и сходства генофондов пород и видов доместицированных животных / Ю. А. Столповский [и др.] // Генетика. - 2010. - Т. 46, № 6. - С. 825-833.
6. Феофилов, А. В. Дифференциация генофондов алтайской и рысистых пород лошадей по ISSR-PCR маркерам / А. В. Феофилов, Н. В. Бардуков, В. И. Глазко // Генетика. - 2011. - Т. 47, № 9. - С. 1230-1235.
7. Korbin, M. Fruit plant germplasm characterisation using molecular markers generated in RAPD and ISSR-PCR / M. Korbin, A. Kuras, E. Żurawicz // Cell. Mol. Biol. Lett. - 2002. - Vol. 7. - P. 785-794.
8. Березовская, О. П. Внутри- и межвидовые различия в ISSR-PCR характеристике шмелей (HYMENOPTERA: BOMBINAE) / О. П. Березовская, О. Ю. Мороз, А. П. Сидоренко // Цитология и генетика. - 2002. - T. 36, № 3. - С. 28-35.
9. Глазко, В. И. Введение в ДНК технологии и биоинформатику / В. И. Глазко, Г. В. Глазко - К., 2001. - 544 c.
10. Kuhl, D. P. A. Trinucleotide repeats and genome variation / D. P. A. Kuhl, C. T. Caskey // Curr Opin Genet. Dev. - 1993. - Vol. 3. - P. 404-407.
11. Воронкова, В. Н. Сравнительный анализ информативности ISSR-маркеров для оценки генетического разнообразия пород лошадей / В. Н. Воронкова, Цэндсурэн Цэдэв, Г. Е. Сулимова // Генетика. - 2011. - Т. 47, № 8. - С. 1131-1134.
Review
For citations:
Kurylenko U.F., Suprun I.A. ISSR-MARKER SYSTEMS USING IN HORSE -BREEDING. Zootechnical Science of Belarus. 2015;50(1):101-108. (In Russ.)
Views: 75
Email this article 